Jaan Toomik 1961-ben született Tartuban (Észtország). 1985–1991 között a tallinni Észt Művészeti Akadémia (Aesti Kunstiakadeemia) festő szakán tanult. 1994-ben részt vett a São Paulo-i Biennálén, 1996-ban az 1. Manifestán Rotterdamban, majd 1997-ben és 2003-ban a Velencei Biennálén. 2005-ben a bukaresti Kortárs Művészeti Múzeumban (Muzeul National de Arta Contemporana) rendeztek nagyszabású tárlatot videómunkáiból. Jelenleg Tallinnban él és dolgozik.